פעילותו של האגף לתכנון כפרי אזורי נובעת ממדיניות משולבת של פיתוח חקלאי, פיתוח כפרי, שיקום ישובים, פיתוח אזורי הפריפריה ותעסוקה יזמית ומגוונת ושמירה על משאבי הטבע ואיכות הסביבה, המהווים תנאי חשוב לעיצוב דמותו העתידית של הכפר בישראל.עבודת האגף באה לענות על צרכים בפיתוח הכפר, הנובעים מתמורות מרחיקות לכת שחלו בכפר ובחקלאות בשני העשורים האחרונים. השינויים העיקריים הם ירידת חלקה של החקלאות בכלכלה הלאומית, התמעטות מספרם של החקלאים בכלל המועסקים והמעבר לתעסוקות ויוזמות חלופיות.שינויים משמעותיים נוספים הם החלשות המערכת הקואופרטיבית, הסטת הדגש מן הכלל אל הפרט, פתיחת היישובים הכפריים לקליטת אוכלוסיה עירונית מבחוץ שהיא עירונית באופייה ומסתמכת על תעסוקה חיצונית, מעבר מחקלאות שוויונית לחקלאות מתמחה עם יתרונות לגודל, צמצום בתמיכות הממשלתיות תוך התאמה להסכמי הסחר הבין-לאומי וכדומה.