בלשכה המשפטית פועלת יחידת תביעות מקצועית המונה שלושה עורכי דין, מתמחה ומזכירה. מחלקת התביעות מטפלת באכיפת החקיקה שבתחום אחריותו של המשרד, בייעוץ משפטי שוטף ליחידות הפיקוח והאכיפה שבמשרד, במתן הנחיות לעריכת חקירות, דיווח למרשם הפלילי על הרשעות, שותפות לקביעת מדיניות אכיפה וענישה ובהתייחסות להצעות חוק ולתיקוני חקיקה בהיבט של האכיפה ובהיבט הפלילי.
התובעים במחלקה הוסמכו על ידי היועץ המשפטי לממשלה לייצג את המדינה בעבירות על חיקוקים שבתחום אחריותו של המשרד, בפני בתי משפט השלום ברחבי הארץ ובערעורים בפני בתי המשפט המחוזיים.
מחלקת התביעות בלשכה המשפטית אחראית לייזום וניסוח חקיקת משנה לפי חוק העבירות המנהליות, לטיפול בבקשות לביטול קנסות מנהליים ובקשות להישפט בעקבות הטלת קנסות מנהליים.