האגף עוסק ברישוי תכשירים לשימוש חקלאי על פי קריטריונים של יעילות בהדברת נגעים, טיפול בפגעים ובטיחות לאדם ולסביבה.
בנוסף, נקבעות רמות לשאריות חומרי הדברה בתוצרת חקלאית ומספר ימי המתנה הנדרשים בין השימוש האחרון בתכשיר לאסיף.
האגף נותן שרותי מעבדות בתחום קביעת שאריות חומרי הדברה ומופקדת על הכרה במעבדות חיצוניות.
פעילויות אלו נועדו להבטיח איכות מזון נאותה ולהגן על בריאות הציבור.
אמנת שירות - המחלקת לתכשירי הדברה