מחלקת משאבי אנוש מטפלת באורח ריכוזי בכל עובדי השירותים הווטרינריים רבתי. המדובר בטיפול כוללני בפרט החל מגיוסו וקליטתו ועד לסיום עבודתו במערכת.
המחלקה מטפלת בנושאים מינהליים נוספים כגון: שירותי כתבנות ומזכירות, שירותי צילום, שכפול ודפוס, מעקב ביצוע חיסונים ובדיקות סרולוגיות, ניהול ארכיב לרשומות רפואיות, ביעור וגניזת מסמכים בשו"ט רבתי, נציגות בוועדת טפסים יעודיים לשירותים הווטרינריים.